VirusSeq
L’initiative VirusSeq du RCanGéCO procède au séquençage de quelque 150 000 échantillons viraux de personnes ayant reçu un diagnostic positif à la COVID-19 et veille à une coordination accrue du séquençage du virus et de la collecte des données cliniques/épidémiologiques connexes entre les provinces et à l’échelle internationale.
Cet effort permet au Canada de suivre comment le virus SRAS-CoV-2, à l’origine de la COVID-19, change et se propage, obtenant ainsi des données clés sur les tendances de la transmission du virus et ses changements qui peuvent nuire à son dépistage ou à l’efficacité des traitements ou des vaccins.
Comme le SRAS-CoV-2 se propage d’une personne à une autre, il continue de muter. Il est possible de suivre ces mutations au moyen du séquençage du génome du virus. Ces mutations peuvent ensuite être utilisées pour produire un « arbre généalogique » de ce virus et de ses « descendants », ce qui aide les chercheurs à établir des liens entre les cas apparentés. Les modifications du virus peuvent aussi influencer la gravité de la maladie ou sa capacité à se propager. Les données des séquences des génomes viraux sont donc devenues un outil essentiel pour les représentants de la santé publique qui peuvent ainsi mieux suivre à la fois les changements et la propagation du virus.
Chronologie du virus
pourquoi séquencer ce virus?
Déterminer et suivre les tendances de la transmission à l’échelle régionale, provinciale, nationale et internationale
Faciliter le dépistage de nouvelles grappes de cas/éclosions
Découvrir les caractéristiques évolutives du virus qui peuvent influencer
• Les méthodes de dépistage (CRP, sérologie)
• Les résultats cliniques (gravité de la souche) et la transmission
• L’efficacité des mesures en soins de santé, les traitements et les vaccins
Coronavirus disease (COVID-19): Outbreak update
See the current situation with total cases, active cases, recovered cases, tests performed or deaths in Canada over time.
Ressources
Schéma du génome du SRAS-CoV-2 qui illustre la complexité des protéines qui y sont codées. Le génome contient deux cadres de lecture ouverts (ORF1a et ORF1b) qui code les polyprotéines 1a et 1b. Ces dernières sont clivées en leurs éléments protéiques individuels après la traduction. Le génome code aussi d’autres protéines, dont les protéines structurales (en particulier la protéine Spike/protéine S/gène), qui sont traduites séparément. Chaque protéine codée par le génome du SRAS-CoV-2 est indiquée individuellement et les différents domaines fonctionnels/structurels sont annotés dans les protéines choisies.
Ressources
Schéma du génome du SRAS-CoV-2 qui illustre la complexité des protéines qui y sont codées. Le génome contient deux cadres de lecture ouverts (ORF1a et ORF1b) qui code les polyprotéines 1a et 1b. Ces dernières sont clivées en leurs éléments protéiques individuels après la traduction. Le génome code aussi d’autres protéines, dont les protéines structurales (en particulier la protéine Spike/protéine S/gène), qui sont traduites séparément. Chaque protéine codée par le génome du SRAS-CoV-2 est indiquée individuellement et les différents domaines fonctionnels/structurels sont annotés